FreeFem sur Qarnot Cloud

FreeFEM est un logiciel libre d'éléments finis utilisé pour résoudre des équations aux dérivées partielles. Il peut être utilisé pour simuler toutes sortes de physiques, et même des problèmes multi-physiques. Un utilisateur doit avoir une bonne compréhension des différentes formulations intégrales, car le code FreeFEM est très proche des mathématiques. L'exécution de votre simulation FreeFEM sur Qarnot est aussi simple que de télécharger votre cas et de lancer un script. Voici un aperçu des différentes étapes.

Version

Le cas de test utilise FreeFEM 4.4-1, sorti en 2020.

Si une autre version vous intéresse, n'hésitez pas à nous envoyer un e-mail à qlab@qarnot.com.

Cas de test

Veuillez vous assurer que vous avez créé un compte Qarnot.

Ce cas de test est basé sur l'exemple de l'Algorithme de Projection pour les Équations de Navier-Stokes. Vous pouvez télécharger le dossier du cas ici, qui contient le script du cas. Vous devez le placer au même niveau que le script de lancement du calcul. Veuillez noter qu'il doit être décompressé avant de pouvoir être utilisé sur Qarnot.

Lancement du cas

Avant de commencer un calcul avec le SDK Python, quelques étapes sont nécessaires :

• Récupérer le jeton d'authentification.
• Installer le SDK Python de Qarnot.

Remarque : en plus du SDK Python, Qarnot fournit des SDK C# et Node.js, ainsi qu'une ligne de commande.

Une fois que tout est configuré, le script suivant doit être utilisé pour démarrer le calcul. Assurez-vous d'avoir copié votre jeton d'authentification dans le script (à la place de <<<MY_SECRET_TOKEN>>>) pour pouvoir lancer la tâche sur Qarnot.

freefem.py

#!/usr/bin/env python

# Import the Qarnot SDK
import qarnot

# Create a connection, from which all other objects will be derived
# Enter client token here
conn = qarnot.connection.Connection(client_token='<<<MY_SECRET_TOKEN>>>')

# Create the task
task = conn.create_task("Hello World - FreeFEM", "docker-batch", 1)

# Create the input bucket and synchronize with a local folder
# Insert a local folder directory
input_bucket = conn.create_bucket("freefem-in")
input_bucket.sync_directory("navierstokes")

# Attach the bucket to the task
task.resources.append(input_bucket)

# Create a result bucket and attach it to the task
task.results = conn.create_bucket("freefem-out")

# Define the Docker image and the command to be run in the container
task.constants["DOCKER_HOST"] = "localhost"
task.constants["DOCKER_REPO"] = "qarnotlab/freefem"
task.constants["DOCKER_TAG"] = "4.4-1"
task.constants["DOCKER_CMD"] = "bash -c '/usr/freefem/bin/ff-mpirun -np \$((\$(nproc)/2)) navierstokes.edp'"

# Submit the task
task.run(output_dir="freefem_results")

Pour lancer ce script, copiez simplement le code précédent dans un script Python, placez-le au même niveau que le dossier navierstokes et exécutez python3 freefem.py & dans votre terminal. Vous devez copier le code du gist (affiché ici) et non le code brut.

Résultats

À tout moment, vous pouvez surveiller l'état de votre tâche sur l'interface web générale de la Console. Lorsque la simulation est terminée, tous ses résultats numériques sont disponibles dans le bucket de sortie. Vous pouvez forcer la prévisualisation des deux fichiers .eps comme des images pour afficher les résultats.

Vous devriez également avoir maintenant un dossier de résultats sur votre ordinateur contenant tous les résultats numériques.

Conclusion

Et voilà ! Si vous avez des questions, veuillez contacter qlab@qarnot.com et nous vous aiderons avec plaisir !